Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Sh3rf1Q69ZI1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Sh3rf1Q69ZI1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Sh3rf1Q69ZI1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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