Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atg9aQ68FE2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atg9aQ68FE2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atg9aQ68FE2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg9aQ68FE2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms