Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CltcQ68FD5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms