Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ino80dQ66JY2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ino80dQ66JY2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ino80dQ66JY2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ino80dQ66JY2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms