Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PtprjQ64455 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PtprjQ64455 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PtprjQ64455 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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