Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim24Q64127 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms