Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms