Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kdm5dQ62240 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kdm5dQ62240 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms