Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scn9aQ62205 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scn9aQ62205 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scn9aQ62205 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Scn9aQ62205 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Scn9aQ62205 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Scn9aQ62205 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Scn9aQ62205 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn9aQ62205 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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