Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rbm38Q62176 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rbm38Q62176 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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