Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itga6Q61739 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga6Q61739 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms