Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ecm1Q61508 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ecm1Q61508 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ecm1Q61508 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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