Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vsx2Q61412 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vsx2Q61412 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vsx2Q61412 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vsx2Q61412 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vsx2Q61412 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vsx2Q61412 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Vsx2Q61412 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vsx2Q61412 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms