Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Foxd1Q61345 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Foxd1Q61345 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Foxd1Q61345 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Foxd1Q61345 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd1Q61345 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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