Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Foxg1Q60987 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms