Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Klf3Q60980 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms