Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc6a4Q60857 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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