Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim38Q5SZ99 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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