Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Bbs12Q5SUD9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bbs12Q5SUD9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms