Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sft2d1Q5SSN7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms