Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm11487Q5RIS0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm11487Q5RIS0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm11487Q5RIS0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms