Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTM8

Rnf20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

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Length 973 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20Q5DTM8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf20Q5DTM8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf20Q5DTM8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf20Q5DTM8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf20Q5DTM8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf20Q5DTM8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf20Q5DTM8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf20Q5DTM8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf20Q5DTM8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf20Q5DTM8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf20Q5DTM8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf20Q5DTM8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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