Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trappc3lQ4KL14 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms