Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pacs2Q3V3Q7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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