Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrrc43Q3V0L5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms