Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp48Q3V0C5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms