Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rnf224Q3UIW8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms