Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Nkx6-3Q3UHX8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Nkx6-3Q3UHX8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nkx6-3Q3UHX8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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