Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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