Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf40Q3U319 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms