Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Otud5Q3U2S4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Otud5Q3U2S4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Otud5Q3U2S4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Otud5Q3U2S4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Otud5Q3U2S4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Otud5Q3U2S4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud5Q3U2S4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms