Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U1D9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U1D9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U1D9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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