Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc9Q3U0M1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms