Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Srsf6Q3TWW8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srsf6Q3TWW8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms