Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccndbp1Q3TVC7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccndbp1Q3TVC7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccndbp1Q3TVC7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ccndbp1Q3TVC7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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