Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

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Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms