Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf3c3Q3TMP1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms