Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms