Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Colec11Q3SXB8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Colec11Q3SXB8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms