Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp1aQ2LKU9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms