Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cpne9Q1RLL3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cpne9Q1RLL3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cpne9Q1RLL3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cpne9Q1RLL3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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