Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trim71Q1PSW8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trim71Q1PSW8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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