Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ptchd1Q14B62 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ptchd1Q14B62 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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