Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Perm1Q149B8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Perm1Q149B8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Perm1Q149B8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Perm1Q149B8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Perm1Q149B8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Perm1Q149B8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Perm1Q149B8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Perm1Q149B8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Perm1Q149B8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms