Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms