Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rab42Q0PD08 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms