Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Znf541Q0GGX2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms