Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HgfQ08048 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HgfQ08048 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms