Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms