Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nfe2Q07279 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nfe2Q07279 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms